Le président, le secrétaire et le trésorier sont élus, le vice-président est le représentant de l'AIHC, le dernier président sortant devient ex-officio conseiller spécial et les autres membres du conseil sont cooptés.

Un Conseil de direction (CD) est composé de trois membres dont le président, le secrétaire et le trésorier du CA. Ces trois dirigeants conservent leur titre au CD et leur mandat est aussi de trois ans.

Quatre Comités de Sélection (CS) distincts et indépendants de Fochapee, sont constitués pour les différents niveaux d'études et pour l'attribution du prix de l'effort. Chaque comité est composé d'au moins 3 membres. Ces membres sont nommés par le Conseil d'administration (CA) de Fochapee pour un mandat de 3 ans renouvelable une fois.